Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rftn1Q6A0D4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn1Q6A0D4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rftn1Q6A0D4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rftn1Q6A0D4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rftn1Q6A0D4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rftn1Q6A0D4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rftn1Q6A0D4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rftn1Q6A0D4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rftn1Q6A0D4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rftn1Q6A0D4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rftn1Q6A0D4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rftn1Q6A0D4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rftn1Q6A0D4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rftn1Q6A0D4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rftn1Q6A0D4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rftn1Q6A0D4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rftn1Q6A0D4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rftn1Q6A0D4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rftn1Q6A0D4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rftn1Q6A0D4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rftn1Q6A0D4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms