Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF7

Cnnm4, Metal transporter CNNM4, mousemouse

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm4Q69ZF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnnm4Q69ZF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cnnm4Q69ZF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnnm4Q69ZF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm4Q69ZF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm4Q69ZF7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm4Q69ZF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm4Q69ZF7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnnm4Q69ZF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnnm4Q69ZF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm4Q69ZF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnnm4Q69ZF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cnnm4Q69ZF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnnm4Q69ZF7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnnm4Q69ZF7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnnm4Q69ZF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnnm4Q69ZF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnnm4Q69ZF7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.8 ms