Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Top2bQ64511 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Top2bQ64511 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Top2bQ64511 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Top2bQ64511 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Top2bQ64511 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Top2bQ64511 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Top2bQ64511 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
Top2bQ64511 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Top2bQ64511 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Top2bQ64511 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Top2bQ64511 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Top2bQ64511 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Top2bQ64511 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Top2bQ64511 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Top2bQ64511 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Top2bQ64511 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
Top2bQ64511 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Top2bQ64511 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Top2bQ64511 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
Top2bQ64511 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Top2bQ64511 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
Top2bQ64511 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Top2bQ64511 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Top2bQ64511 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Top2bQ64511 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Top2bQ64511 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Top2bQ64511 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Top2bQ64511 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Top2bQ64511 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Top2bQ64511 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Top2bQ64511 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Top2bQ64511 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Top2bQ64511 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Top2bQ64511 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Top2bQ64511 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Top2bQ64511 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Top2bQ64511 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Top2bQ64511 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Top2bQ64511 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Top2bQ64511 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms