Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtprdQ64487 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtprdQ64487 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprdQ64487 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtprdQ64487 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprdQ64487 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprdQ64487 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprdQ64487 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PtprdQ64487 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprdQ64487 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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