Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan7Q62283 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan7Q62283 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan7Q62283 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan7Q62283 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan7Q62283 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan7Q62283 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan7Q62283 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan7Q62283 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan7Q62283 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan7Q62283 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan7Q62283 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan7Q62283 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan7Q62283 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan7Q62283 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms