Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms