Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SrmsQ62270 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrmsQ62270 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SrmsQ62270 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrmsQ62270 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrmsQ62270 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SrmsQ62270 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SrmsQ62270 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms