Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpcQ62241 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpcQ62241 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SnrpcQ62241 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SnrpcQ62241 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpcQ62241 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpcQ62241 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms