Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccna1Q61456 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccna1Q61456 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccna1Q61456 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccna1Q61456 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccna1Q61456 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccna1Q61456 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccna1Q61456 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccna1Q61456 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccna1Q61456 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccna1Q61456 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccna1Q61456 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccna1Q61456 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms