Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc125Q5U465 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc125Q5U465 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc125Q5U465 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc125Q5U465 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc125Q5U465 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc125Q5U465 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc125Q5U465 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc125Q5U465 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc125Q5U465 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc125Q5U465 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc125Q5U465 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc125Q5U465 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc125Q5U465 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc125Q5U465 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms