Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmo1Q5SXG7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmo1Q5SXG7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmo1Q5SXG7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmo1Q5SXG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms