Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWT3

Slc25a35, Solute carrier family 25 member 35, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a35Q5SWT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc25a35Q5SWT3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc25a35Q5SWT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc25a35Q5SWT3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc25a35Q5SWT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc25a35Q5SWT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc25a35Q5SWT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc25a35Q5SWT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc25a35Q5SWT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc25a35Q5SWT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc25a35Q5SWT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc25a35Q5SWT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc25a35Q5SWT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc25a35Q5SWT3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms