Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r195Q5SVD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r195Q5SVD6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r195Q5SVD6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r195Q5SVD6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r195Q5SVD6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms