Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynrgQ5SV85 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SynrgQ5SV85 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SynrgQ5SV85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SynrgQ5SV85 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SynrgQ5SV85 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SynrgQ5SV85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SynrgQ5SV85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SynrgQ5SV85 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SynrgQ5SV85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SynrgQ5SV85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SynrgQ5SV85 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynrgQ5SV85 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SynrgQ5SV85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SynrgQ5SV85 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SynrgQ5SV85 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SynrgQ5SV85 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SynrgQ5SV85 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SynrgQ5SV85 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SynrgQ5SV85 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SynrgQ5SV85 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms