Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Mdc1Q5PSV9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Mdc1Q5PSV9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Mdc1Q5PSV9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Mdc1Q5PSV9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Mdc1Q5PSV9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Mdc1Q5PSV9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Mdc1Q5PSV9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Mdc1Q5PSV9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Mdc1Q5PSV9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Mdc1Q5PSV9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Mdc1Q5PSV9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Mdc1Q5PSV9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Mdc1Q5PSV9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mdc1Q5PSV9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Mdc1Q5PSV9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Mdc1Q5PSV9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Mdc1Q5PSV9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Mdc1Q5PSV9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms