Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Rapgef6Q5NCJ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rapgef6Q5NCJ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rapgef6Q5NCJ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
Rapgef6Q5NCJ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Rapgef6Q5NCJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Rapgef6Q5NCJ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rapgef6Q5NCJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rapgef6Q5NCJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rapgef6Q5NCJ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rapgef6Q5NCJ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rapgef6Q5NCJ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rapgef6Q5NCJ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Rapgef6Q5NCJ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rapgef6Q5NCJ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rapgef6Q5NCJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rapgef6Q5NCJ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rapgef6Q5NCJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Rapgef6Q5NCJ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rapgef6Q5NCJ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rapgef6Q5NCJ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rapgef6Q5NCJ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Rapgef6Q5NCJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rapgef6Q5NCJ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms