Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf488Q5HZG9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf488Q5HZG9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Znf488Q5HZG9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf488Q5HZG9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf488Q5HZG9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Znf488Q5HZG9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf488Q5HZG9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf488Q5HZG9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms