Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Taf3Q5HZG4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Taf3Q5HZG4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Taf3Q5HZG4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Taf3Q5HZG4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Taf3Q5HZG4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Taf3Q5HZG4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Taf3Q5HZG4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms