Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Eri2Q5BKS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eri2Q5BKS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eri2Q5BKS4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Eri2Q5BKS4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Eri2Q5BKS4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eri2Q5BKS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eri2Q5BKS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eri2Q5BKS4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eri2Q5BKS4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eri2Q5BKS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eri2Q5BKS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eri2Q5BKS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms