Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc84Q4VA36 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc84Q4VA36 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc84Q4VA36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc84Q4VA36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc84Q4VA36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc84Q4VA36 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc84Q4VA36 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc84Q4VA36 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc84Q4VA36 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc84Q4VA36 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc84Q4VA36 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc84Q4VA36 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc84Q4VA36 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc84Q4VA36 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc84Q4VA36 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc84Q4VA36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc84Q4VA36 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc84Q4VA36 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc84Q4VA36 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc84Q4VA36 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc84Q4VA36 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc84Q4VA36 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc84Q4VA36 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc84Q4VA36 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2340 ms