Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Khdc1cQ4KL78 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Khdc1cQ4KL78 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Khdc1cQ4KL78 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Khdc1cQ4KL78 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Khdc1cQ4KL78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms