Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pydc3Q3V3Q4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pydc3Q3V3Q4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pydc3Q3V3Q4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pydc3Q3V3Q4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pydc3Q3V3Q4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pydc3Q3V3Q4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms