Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd3l2Q3UXB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd3l2Q3UXB0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mbd3l2Q3UXB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mbd3l2Q3UXB0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms