Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm29609Q3UU56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm29609Q3UU56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm29609Q3UU56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm29609Q3UU56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm29609Q3UU56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm29609Q3UU56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm29609Q3UU56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm29609Q3UU56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm29609Q3UU56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm29609Q3UU56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm29609Q3UU56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm29609Q3UU56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm29609Q3UU56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm29609Q3UU56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms