Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
B230104I21RikQ3USW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
B230104I21RikQ3USW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
B230104I21RikQ3USW4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
B230104I21RikQ3USW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
B230104I21RikQ3USW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B230104I21RikQ3USW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
B230104I21RikQ3USW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms