Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3gnt6Q3USF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B3gnt6Q3USF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B3gnt6Q3USF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B3gnt6Q3USF0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3gnt6Q3USF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms