Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsf3Q3URE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsf3Q3URE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsf3Q3URE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsf3Q3URE1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsf3Q3URE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsf3Q3URE1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acsf3Q3URE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsf3Q3URE1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsf3Q3URE1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsf3Q3URE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsf3Q3URE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsf3Q3URE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms