Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ22

Ntn5, Netrin-5, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn5Q3UQ22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn5Q3UQ22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntn5Q3UQ22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntn5Q3UQ22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntn5Q3UQ22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntn5Q3UQ22 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ntn5Q3UQ22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ntn5Q3UQ22 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms