Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnep1r1Q3UJ81 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnep1r1Q3UJ81 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnep1r1Q3UJ81 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnep1r1Q3UJ81 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnep1r1Q3UJ81 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnep1r1Q3UJ81 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms