Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mcrip1Q3UGS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mcrip1Q3UGS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mcrip1Q3UGS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mcrip1Q3UGS4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mcrip1Q3UGS4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mcrip1Q3UGS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms