Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q3U1D9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q3U1D9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q3U1D9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U1D9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q3U1D9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q3U1D9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U1D9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q3U1D9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3U1D9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3U1D9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U1D9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3U1D9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U1D9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U1D9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U1D9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3U1D9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U1D9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U1D9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U1D9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3U1D9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U1D9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U1D9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U1D9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U1D9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U1D9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U1D9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U1D9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q3U1D9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms