Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasip1Q3U0S6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasip1Q3U0S6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rasip1Q3U0S6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rasip1Q3U0S6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rasip1Q3U0S6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rasip1Q3U0S6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rasip1Q3U0S6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rasip1Q3U0S6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasip1Q3U0S6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rasip1Q3U0S6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rasip1Q3U0S6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rasip1Q3U0S6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rasip1Q3U0S6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rasip1Q3U0S6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms