Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
InipQ3TXT3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
InipQ3TXT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
InipQ3TXT3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
InipQ3TXT3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
InipQ3TXT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InipQ3TXT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms