Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc28Q3TX51 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc28Q3TX51 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc28Q3TX51 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc28Q3TX51 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrc28Q3TX51 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc28Q3TX51 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc28Q3TX51 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc28Q3TX51 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc28Q3TX51 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms