Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWI9

Tmem63b, CSC1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem63bQ3TWI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmem63bQ3TWI9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem63bQ3TWI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem63bQ3TWI9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmem63bQ3TWI9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem63bQ3TWI9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem63bQ3TWI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmem63bQ3TWI9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem63bQ3TWI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmem63bQ3TWI9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem63bQ3TWI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem63bQ3TWI9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem63bQ3TWI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem63bQ3TWI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem63bQ3TWI9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem63bQ3TWI9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem63bQ3TWI9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms