Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQZ4

Gm2016, Predicted gene 2016, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2016Q3TQZ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm2016Q3TQZ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2016Q3TQZ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2016Q3TQZ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2016Q3TQZ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2016Q3TQZ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2016Q3TQZ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2016Q3TQZ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2016Q3TQZ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2016Q3TQZ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms