Protein–RNA interactions for Protein: Q2WF71

Lrfn1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn1Q2WF71 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrfn1Q2WF71 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrfn1Q2WF71 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrfn1Q2WF71 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrfn1Q2WF71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn1Q2WF71 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrfn1Q2WF71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrfn1Q2WF71 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrfn1Q2WF71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.5 ms