Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem52bQ0VBF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem52bQ0VBF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem52bQ0VBF2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem52bQ0VBF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem52bQ0VBF2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem52bQ0VBF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms