Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Lrriq1Q0P5X1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Lrriq1Q0P5X1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Lrriq1Q0P5X1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
Lrriq1Q0P5X1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Lrriq1Q0P5X1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Lrriq1Q0P5X1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.39
Lrriq1Q0P5X1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
Lrriq1Q0P5X1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Lrriq1Q0P5X1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Lrriq1Q0P5X1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Lrriq1Q0P5X1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Lrriq1Q0P5X1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.38
Lrriq1Q0P5X1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Lrriq1Q0P5X1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Lrriq1Q0P5X1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Lrriq1Q0P5X1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Lrriq1Q0P5X1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Lrriq1Q0P5X1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Lrriq1Q0P5X1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Lrriq1Q0P5X1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Lrriq1Q0P5X1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Lrriq1Q0P5X1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Lrriq1Q0P5X1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Lrriq1Q0P5X1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Lrriq1Q0P5X1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Lrriq1Q0P5X1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Lrriq1Q0P5X1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Lrriq1Q0P5X1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Lrriq1Q0P5X1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Lrriq1Q0P5X1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Lrriq1Q0P5X1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Lrriq1Q0P5X1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Lrriq1Q0P5X1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Lrriq1Q0P5X1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Lrriq1Q0P5X1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Lrriq1Q0P5X1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Lrriq1Q0P5X1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Lrriq1Q0P5X1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Lrriq1Q0P5X1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Lrriq1Q0P5X1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Lrriq1Q0P5X1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Lrriq1Q0P5X1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Lrriq1Q0P5X1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms