Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc21bQ0HA38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc21bQ0HA38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc21bQ0HA38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ttc21bQ0HA38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ttc21bQ0HA38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ttc21bQ0HA38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ttc21bQ0HA38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ttc21bQ0HA38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ttc21bQ0HA38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ttc21bQ0HA38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ttc21bQ0HA38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ttc21bQ0HA38 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ttc21bQ0HA38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ttc21bQ0HA38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ttc21bQ0HA38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ttc21bQ0HA38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ttc21bQ0HA38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ttc21bQ0HA38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ttc21bQ0HA38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ttc21bQ0HA38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ttc21bQ0HA38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ttc21bQ0HA38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ttc21bQ0HA38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Ttc21bQ0HA38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Ttc21bQ0HA38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ttc21bQ0HA38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ttc21bQ0HA38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ttc21bQ0HA38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ttc21bQ0HA38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ttc21bQ0HA38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ttc21bQ0HA38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ttc21bQ0HA38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ttc21bQ0HA38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ttc21bQ0HA38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ttc21bQ0HA38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ttc21bQ0HA38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ttc21bQ0HA38 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ttc21bQ0HA38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ttc21bQ0HA38 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ttc21bQ0HA38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms