Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tfdp1Q08639 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Tfdp1Q08639 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tfdp1Q08639 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tfdp1Q08639 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tfdp1Q08639 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tfdp1Q08639 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tfdp1Q08639 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfdp1Q08639 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tfdp1Q08639 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfdp1Q08639 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tfdp1Q08639 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms