Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ascl1Q02067 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ascl1Q02067 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ascl1Q02067 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ascl1Q02067 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ascl1Q02067 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ascl1Q02067 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms