Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dgcr2P98154 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dgcr2P98154 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dgcr2P98154 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dgcr2P98154 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dgcr2P98154 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dgcr2P98154 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dgcr2P98154 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dgcr2P98154 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms