Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rbbp6P97868 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rbbp6P97868 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rbbp6P97868 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rbbp6P97868 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rbbp6P97868 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rbbp6P97868 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rbbp6P97868 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rbbp6P97868 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rbbp6P97868 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rbbp6P97868 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rbbp6P97868 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Rbbp6P97868 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rbbp6P97868 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rbbp6P97868 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rbbp6P97868 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rbbp6P97868 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rbbp6P97868 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rbbp6P97868 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rbbp6P97868 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Rbbp6P97868 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rbbp6P97868 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rbbp6P97868 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rbbp6P97868 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rbbp6P97868 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rbbp6P97868 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rbbp6P97868 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rbbp6P97868 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rbbp6P97868 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rbbp6P97868 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rbbp6P97868 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rbbp6P97868 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms