Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Xrn1P97789 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Xrn1P97789 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Xrn1P97789 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Xrn1P97789 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Xrn1P97789 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Xrn1P97789 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Xrn1P97789 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Xrn1P97789 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Xrn1P97789 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Xrn1P97789 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Xrn1P97789 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Xrn1P97789 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Xrn1P97789 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Xrn1P97789 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Xrn1P97789 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Xrn1P97789 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Xrn1P97789 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Xrn1P97789 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Xrn1P97789 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Xrn1P97789 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Xrn1P97789 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Xrn1P97789 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Xrn1P97789 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Xrn1P97789 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Xrn1P97789 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms