Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx3-2P97503 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx3-2P97503 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx3-2P97503 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx3-2P97503 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nkx3-2P97503 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nkx3-2P97503 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx3-2P97503 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx3-2P97503 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx3-2P97503 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms