Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RhodP97348 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RhodP97348 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RhodP97348 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RhodP97348 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RhodP97348 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RhodP97348 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RhodP97348 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhodP97348 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RhodP97348 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhodP97348 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RhodP97348 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhodP97348 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhodP97348 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RhodP97348 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RhodP97348 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RhodP97348 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RhodP97348 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhodP97348 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RhodP97348 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RhodP97348 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhodP97348 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RhodP97348 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhodP97348 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhodP97348 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RhodP97348 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhodP97348 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhodP97348 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RhodP97348 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RhodP97348 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RhodP97348 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhodP97348 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhodP97348 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RhodP97348 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhodP97348 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RhodP97348 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RhodP97348 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RhodP97348 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhodP97348 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RhodP97348 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RhodP97348 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RhodP97348 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RhodP97348 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RhodP97348 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RhodP97348 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RhodP97348 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RhodP97348 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RhodP97348 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhodP97348 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RhodP97348 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhodP97348 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhodP97348 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhodP97348 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RhodP97348 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RhodP97348 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RhodP97348 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RhodP97348 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RhodP97348 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RhodP97348 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhodP97348 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhodP97348 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhodP97348 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RhodP97348 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RhodP97348 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RhodP97348 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RhodP97348 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhodP97348 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhodP97348 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhodP97348 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhodP97348 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhodP97348 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RhodP97348 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhodP97348 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhodP97348 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhodP97348 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhodP97348 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhodP97348 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhodP97348 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhodP97348 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhodP97348 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhodP97348 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RhodP97348 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhodP97348 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhodP97348 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhodP97348 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhodP97348 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhodP97348 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhodP97348 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhodP97348 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhodP97348 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhodP97348 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhodP97348 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhodP97348 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhodP97348 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhodP97348 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhodP97348 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhodP97348 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhodP97348 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhodP97348 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhodP97348 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms