Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgcdP82347 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgcdP82347 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SgcdP82347 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgcdP82347 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SgcdP82347 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgcdP82347 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SgcdP82347 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgcdP82347 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SgcdP82347 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgcdP82347 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms