Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otx2P80206 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Otx2P80206 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otx2P80206 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Otx2P80206 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otx2P80206 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otx2P80206 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otx2P80206 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otx2P80206 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otx2P80206 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otx2P80206 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otx2P80206 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otx2P80206 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otx2P80206 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otx2P80206 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otx2P80206 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otx2P80206 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otx2P80206 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otx2P80206 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otx2P80206 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms