Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm2aP59997 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Kdm2aP59997 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kdm2aP59997 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Kdm2aP59997 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Kdm2aP59997 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Kdm2aP59997 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Kdm2aP59997 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Kdm2aP59997 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm2aP59997 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Kdm2aP59997 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Kdm2aP59997 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm2aP59997 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm2aP59997 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm2aP59997 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Kdm2aP59997 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Kdm2aP59997 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm2aP59997 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm2aP59997 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm2aP59997 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Kdm2aP59997 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Kdm2aP59997 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms