Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AgrpP56473 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AgrpP56473 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AgrpP56473 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrpP56473 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AgrpP56473 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AgrpP56473 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AgrpP56473 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AgrpP56473 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AgrpP56473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AgrpP56473 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AgrpP56473 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrpP56473 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AgrpP56473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrpP56473 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AgrpP56473 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrpP56473 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AgrpP56473 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms